本作では、登場する敵キャラクターの種類も多く、その数はシリーズ史上最多。パワーモンスター系、魔法使い系、物を盗む盗賊系など、RPGらしい個性や特徴を持つ敵が多数用意されている。敵にはいくつかの「系統」が存在する。ほとんどの敵は何かの「系統」に属しておりその中で強さの段階（グレード）分けがされている。たとえば下にある「ギャング」の系統は、最も弱いのが「カラーギャング」、一段強いグレードは「マッドギャング」、さらに強くなったグレードは「ギャングエース」、最も強いグレードは「ギャングボス」というようになっている。

街で悪さをしているヤクザやチンピラとはまた異なったバイオレンスさを誇る系統。

下位2種（カラーギャング、マッドギャング）は拳で攻撃を仕掛けてくるだけだが、上位2種（ギャングエース、ギャングボス）は拳銃を容赦なく発砲してくる強敵。銃撃は防御できない危険な攻撃なので、見かけるようになったら装備と回復アイテムを買いそろえておこう。

右手にククリナイフ、左手にボウガンを持ち、遠近両方に攻撃できる能力を持った系統。
軍人系のグレードは「軍事オタク」、「孤独なアーミー」、「やつざきコマンドー」、「アーミネーター」の順に強くなっている。

グレードが上がるにつれてナイフの斬撃、手榴弾の爆撃、ボウガンの連射といった、武器を用いた技を駆使してくる。最上位のアーミネーターにもなると、「破壊光線」というビームを目から発射する。人間なのかどうかすら謎に包まれた敵だ。